Laboratoriji so oblikovani za praktično izvajanje raziskovalnega in izobraževalnega dela v obliki raziskovalnih nalog in projektov. Na fakulteti delujejo naslednji laboratoriji:

• Laboratorij za inženiring poslovnih in produkcijskih sistemov (LIPPS)
• Laboratorij 10ka

Centri

• Center za empirično proučevanje organizacij (CEPO)